CURSO LINUX Y HPC PARA GENÓMICA
En la era moderna de la producción animal y de acuicultura, la genómica emerge como una poderosa herramienta que transforma radicalmente nuestra capacidad para entender y mejorar la calidad genética de las especies criadas para diversos fines. En esta unidad, exploraremos cómo la genómica se aplica a la producción animal, aprovechando herramientas tecnológicas como Linux, Python y supercomputadoras para analizar datos genómicos a gran escala y tomar decisiones con base a los datos. Se profundiza en la aplicación de tecnologías de secuenciación masiva (NGS) y genotipificación en mejora genética animal y de acuicultura. Los contenidos se ilustran con ejemplos de distintos sistemas de producción animal y acuícola, y las actividades prácticas se desarrollan principalmente en el entorno operativo Linux, utilizando lenguajes de programación como R y Python, así como otras plataformas y software especializados en genómica y bioinformática. Parte del trabajo práctico se realizará en la plataforma Posit Cloud (https://posit.cloud) y en el sistema de computación de alto rendimiento HPC OCÉANO de la PUCV (https://hpcoceano.pucv.cl).
Dirigido a
Profesionales, graduados o investigadores interesados en la mejora genética y la genómica aplicada a la producción animal y a la acuicultura.
REQUISITOS DE POSTULACIÓN
-Título profesional o licenciatura.
-Programación: Este curso asume un conocimientos y competencias básicas en programación con R y Shell de Unix. Los alumnos que no posean estos conocimientos y competencias deberán adquirirlos durante el diplomado para que puedan alcanzar una comprensión avanzada de las materias cubiertas en el curso.
-Inglés: Todos los softwares utilizados y el 50% del material de estudio en el curso están en inglés. Alumnos sin competencias de lectura en inglés no deberían tomar el curso.